Die Bibliothek ist eine Schatzkammer auf allen Gebieten der Wissenschaft des 15. bis 18. Jahrhunderts. Neben wertvollen Bibelausgaben und weiterer theologischer Werke, vor allem aus der Zeit der Reformation, sind seltene alte Drucke der Jurisprudenz, Medizin, Geschichte, Philosophie, Geographie, Astronomie, Astrologie, Physik, Chemie, Mathematik, aber auch der frühen Reiseliteratur und Flugschriften vorhanden. Eine reichhaltige hymnologische Sammlung mit Notenmanuskripten, Erstdrucken bedeutender Komponisten des 17. Jahrhunderts und ca. 7.000 Gesangbüchern, sowie eine Halensia-Sammlung mit ca. 3500 Titeln zur Stadt- und Regionalgeschichte, darunter handschriftliche Chroniken, vervollständigen den Bestand, der z.Z. reichlich 36.000 Bände mit über 100.000 Titeln, darunter mehr als vierhundert Inkunabeln und ca. dreihundert Handschriften, umfasst.